El doctor Héctor Arita realiza proyectos de investigación que se enfocan en la comprensión de los patrones de composición, estructura y diversidad de los conjuntos de especies a nivel local (ecología de comunidades) y regional y continental (macroecología). Realiza también investigaciones sobre las aplicaciones de estos estudios a la conservación de la diversidad biológica. Los modelos que desarrolla tienen aplicación para cualquier conjunto de especies o unidades filogenéticas en cualquier tipo de ecosistema. Dedica buena parte de su tiempo a ofrecer diversos cursos en ecología, conservación biológica, modelación matemática y fotografía científica y a la producción de artículos de divulgación sobre temas ecológicos en revistas, periódicos y medios electrónicos.

En colaboración con la Cátedra Extraordinaria José Emilio Pacheco.