Profesor ICREA, actual director del departamento de Ciencias de la Vida del Barcelona Supercomputing Center y del Instituto Nacional de Bioinformática (INB-ISCIII). Estudió en las Universidades Complutense y Autónoma de Madrid, y en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular. Ha sido profesor de investigación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas en el Centro Nacional de Biotecnología (1994-2006) y vicedirector del Centro Nacional De Investigaciones Oncologicas (2006-2016), doctor honoris causa de la Universidad Técnica de Dinamarca y miembro electo de la Organización Europea de Biología Molecular (EMBO, por sus siglas en inglés). Como biólogo computacional su trabajo se dedica a la comprensión mecanicista de los sistemas biológicos (por ejemplo, cáncer y otras enfermedades), combinando enfoques de bioinformática, biología de redes y aprendizaje automático. Temas en los que Valencia ha publicado más de 400 artículos científicos.